開發一個物流同城配送小程序系統需要經過以下步驟：

1. 需求分析：首先，需要明確小程序的目標用戶、核心功能和預算。常見的功能包括用戶注冊登錄、寄件、收件、訂單管理、支付、騎手接單、定位跟蹤等。

2. 設計階段：根據需求分析結果進行ui/ux設計，包括小程序頁面布局、界面元素、配色方案等，確保用戶體驗良好。

3. 技術選型：確定小程序開發的技術棧。對于微信小程序，可以使用微信小程序官方提供的開發框架和api；對于支付寶小程序，可以使用支付寶小程序的開發工具包。

4. 開發階段：

   （1） 搭建開發環境：安裝相應的ide（集成開發環境），例如微信開發者工具。

   （2） 前端開發：使用html、css、javascript以及小程序框架進行頁面開發，實現用戶界面和交互邏輯。

   （3） 后端開發：可以選擇node.js、python、java、php等語言，結合數據庫（如mysql、mongodb）進行服務器端的開發，實現數據處理和業務邏輯。

   （4） api開發：創建restful api或graphql api供前后端交互數據。

5. 測試階段：進行系統測試，包括功能測試、性能測試、安全測試等，確保系統穩定運行并修復發現的問題。

6. 上線前準備：

   （1） 配置域名、服務器，確保https支持。

   （2） 申請小程序相關賬號，完成認證。

   （3） 將小程序提交到微信、支付寶等平臺審核。

7. 上線與推廣：通過審核后，小程序即可上線。之后可以制定推廣計劃吸引用戶下載使用。

8. 維護與迭代：根據用戶反饋和市場變化，持續優化小程序的功能和體驗。

在技術層面，以下是一些建議：

1. 使用云服務：考慮使用阿里云、騰訊云等云服務提供商來部署你的應用，這些服務提供了可靠的服務器、數據庫服務和其他必要的后端服務。

2. 利用位置服務：同城配送服務中，實時定位和路徑規劃是關鍵，可以使用高德地圖、騰訊地圖等服務的api來實現。

3. 第三方支付：接入微信支付、支付寶支付等第三方支付服務，為用戶提供便捷的支付方式。

4. 短信和推送通知服務：使用短信服務和小程序的模板消息推送服務來及時通知用戶和配送人員訂單狀態的更新。

小程序系統開發是一個復雜的過程，涉及到多個環節和技術細節，需要的開發團隊協作完成。同時，還需要遵守相關法律法規和平臺規定，確保用戶數據的安全性和隱私保護。